De 1964 à 1976, Jacques Chapuis dirige l’Ecole Jurassienne et Conservatoire de Delémont. Le programme mis en place permet de relier une éducation musicale active par le biais de l’implantation de la méthode Willems® et réceptive grâce aux concerts commentés. L’éducation instrumentale s’inspire des mêmes principes. C’est dans ce contexte que se crée le premier Institut Willems®.
A la présidence de l’Association Internationale Willems®, Jacques Chapuis organise une trentaine de congrès et de stages d’éducation musicale et instrumentale dans divers pays. Entraînée par son développement en France, l’Association s’établit à Metz. A ce jour, la Fédération Internationale Willems® a son siège à Lyon.
Jusqu’à la fin de sa vie, à travers les multiples formes de son activité, et l’expérience cumulée qui en résulte, Jacques Chapuis a recherché, et très souvent atteint, la relation entre l’art musical (pour lui comme interprète au piano) et l’art d’enseigner. Dans ses choix de transmission il n’a eu de cesse, sans relâche et sans concession, de révéler, d’entretenir et d’intensifier l’amour et l’enthousiasme générés par le phénomène musical vivant.
C’est aussi à Jacques Chapuis que l’on doit le développement des Jeunesses Musicales en Suisse sous l’impulsion de Dinu Lipatti.